Shaun is een intelligent schaap dat avonturen beleeft op de boerderij waar hij woont. Shaun is geen kuddedier, zoals de andere schapen en komt hierdoor regelmatig in bijzondere situaties terecht, samen met de boerderijhond Bitzer, de drie ondeugende biggen of de kudde.

In deze nieuwe film beleeft Shaun een spectaculair avontuur met een buitenaards wezen dat in de buurt van de boerderij is neergestort.